파이썬 Zappa를 사용하여 AWS Comprehend Medical를 통한 의료 데이터 분석 애플리케이션 구축하기

26 Sep 2023

python

의료 데이터 분석은 현대 의료 시스템의 핵심 요소 중 하나입니다. AWS Comprehend Medical는 의료 데이터를 이해하고 분석하는 데 도움을 주는 강력한 도구입니다. 이번 블로그 포스트에서는 파이썬 프레임워크인 Zappa를 사용하여 AWS Comprehend Medical를 활용한 의료 데이터 분석 애플리케이션을 구축하는 방법을 알아보겠습니다.

Zappa란?

Zappa는 파이썬 웹 애플리케이션을 쉽게 배포하고 운영할 수 있도록 도와주는 프레임워크입니다. Zappa를 사용하면 AWS Lambda와 API Gateway를 이용하여 서버리스 아키텍쳐로 애플리케이션을 배포할 수 있습니다.

AWS Comprehend Medical란?

AWS Comprehend Medical은 의료 데이터를 분석하고 의료 용어를 추출하여 의학적 의미를 파악하는 기능을 제공합니다. 이를 통해 의료 기록, 클리니컬 트라이얼, 의학 문헌 등 다양한 의료 데이터를 효과적으로 분석할 수 있습니다.

애플리케이션 구축하기

가상 환경 설정하기

python -m venv myenv
source myenv/bin/activate

필요한 패키지 설치하기
```
pip install flask zappa awscli
```

Flask 애플리케이션 작성하기

from flask import Flask, request, jsonify
import boto3

app = Flask(__name__)

@app.route('/')
def index():
    return 'Hello, World!'

@app.route('/analyze', methods=['POST'])
def analyze_text():
    text = request.json['text']

    comprehend = boto3.client('comprehendmedical')
    response = comprehend.detect_entities_v2(Text=text)

    return jsonify(response)

if __name__ == '__main__':
    app.run()

Zappa 설정 파일 생성하기

{
    "dev": {
        "app_function": "main.app",
        "aws_region": "us-east-1",
        "s3_bucket": "my-s3-bucket",
        "debug": true
    }
}

애플리케이션 배포하기
```
zappa deploy dev
```

API Gateway 엔드포인트 확인하기

https://xxxxxx.execute-api.us-east-1.amazonaws.com/dev

의료 데이터 분석하기

import requests

API_ENDPOINT = 'https://xxxxxx.execute-api.us-east-1.amazonaws.com/dev/analyze'

data = {'text': 'Patient has a history of heart disease.'}

response = requests.post(API_ENDPOINT, json=data)

print(response.json())

위의 단계를 따라하면 Zappa를 사용하여 AWS Comprehend Medical를 통한 의료 데이터 분석 애플리케이션을 손쉽게 구축할 수 있습니다. 이를 통해 의료 데이터의 효율적인 분석과 의학적 의미 파악에 도움을 줄 수 있습니다.

#AWS #Python