[python] SciPy를 사용하여 주성분 분석 수행하기

주성분 분석(principal component analysis, PCA)은 다차원 데이터의 차원을 축소하면서 가장 많은 정보를 보존하는 기법입니다. 이 기법은 데이터를 효율적으로 요약하고 시각화하는 데 매우 유용하며, 데이터 마이닝, 패턴 인식, 이미지 처리 등 다양한 분야에서 활용됩니다.

Python에서는 SciPy 라이브러리를 사용하여 주성분 분석을 수행할 수 있습니다. SciPy는 Python 기반의 과학 및 공학 계산을 위한 강력한 도구 모음이며, 다양한 수치 계산기능을 제공합니다.

SciPy 설치

먼저, SciPy를 설치해야 합니다. 아래의 명령어를 사용하여 SciPy를 설치할 수 있습니다.

pip install scipy

주성분 분석 수행하기

이제 SciPy를 사용하여 주성분 분석을 수행해보겠습니다. 아래는 예시 데이터를 사용한 주성분 분석 코드입니다.

import numpy as np
from scipy import linalg

# 예시 데이터
data = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])

# 데이터의 평균 중심화
mean_centered_data = data - np.mean(data, axis=0)

# 공분산 행렬 계산
cov_matrix = np.cov(mean_centered_data.T)

# 공분산 행렬의 고유값과 고유벡터 계산
eigen_values, eigen_vectors = linalg.eig(cov_matrix)

# 고유값을 기준으로 고유벡터 정렬
sorted_eigen_vectors = eigen_vectors[:, np.argsort(eigen_values)[::-1]]

# 주성분 추출
principal_components = sorted_eigen_vectors[:, :2]

# 주성분 분석 결과 출력
print("주성분 분석 결과:")
print(principal_components)

위의 코드에서 data는 주성분 분석을 수행할 데이터입니다. 데이터는 다차원 배열로 표현되며, 각 행은 관측치를 나타내고 각 열은 변수를 나타냅니다. 예시 데이터에서는 3차원 데이터를 사용하였습니다.

주성분 분석을 위해 아래의 단계를 수행합니다:

  1. 데이터의 평균을 구하여 데이터를 평균 중심화합니다.
  2. 평균 중심화된 데이터의 공분산 행렬을 계산합니다.
  3. 공분산 행렬의 고유값과 고유벡터를 계산합니다.
  4. 고유값을 기준으로 고유벡터를 정렬합니다.
  5. 정렬된 고유벡터를 사용하여 주성분을 추출합니다.

주성분 분석 결과인 principal_components는 주성분을 열로 가지는 2차원 배열입니다. 위의 코드에서는 데이터의 첫 번째와 두 번째 주성분을 추출하였습니다.

마무리

이제 당신은 SciPy를 사용하여 주성분 분석을 수행하는 법을 알게 되었습니다. SciPy는 강력한 도구 모음이므로, 다양한 데이터 분석 작업에 널리 활용될 수 있습니다. 추가적으로 SciPy의 다양한 기능을 찾아보고 활용해보세요!

References